Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INTS3Q68E01 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms