Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms