Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALS2CLQ60I27 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms