Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf57Q5W0N0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf57Q5W0N0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms