Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB2Q5VUJ9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
EFCAB2Q5VUJ9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
EFCAB2Q5VUJ9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms