Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRCH2Q5VUJ6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH2Q5VUJ6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms