Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC01545Q5VT33 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01545Q5VT33 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01545Q5VT33 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms