Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF5Q5TYX0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms