Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LDLRAD1Q5T700 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms