Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECTD3Q5T447 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HECTD3Q5T447 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms