Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWA1

PPP1R15B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 15B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R15BQ5SWA1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R15BQ5SWA1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R15BQ5SWA1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms