Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CEP170Q5SW79 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms