Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAPCD1Q5SSQ6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms