Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRMS1LQ5PSV4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1LQ5PSV4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1LQ5PSV4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1LQ5PSV4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1LQ5PSV4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1LQ5PSV4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1LQ5PSV4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1LQ5PSV4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1LQ5PSV4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1LQ5PSV4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1LQ5PSV4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1LQ5PSV4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1LQ5PSV4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1LQ5PSV4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRMS1LQ5PSV4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms