Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FGD3Q5JSP0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FGD3Q5JSP0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FGD3Q5JSP0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms