Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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C9orf116Q5BN46 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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C9orf116Q5BN46 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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C9orf116Q5BN46 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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C9orf116Q5BN46 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf116Q5BN46 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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