Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSD17B12Q53GQ0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms