Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP55Q53EZ4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP55Q53EZ4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms