Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKDCCQ504Y2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms