Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SV2CQ496J9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms