Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIDA1Q1XH10 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
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