Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTL8BQ17RB0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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