Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP6Q16828 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DUSP6Q16828 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP6Q16828 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
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