Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HIST2H2ACQ16777 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIST2H2ACQ16777 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms