Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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