Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NREPQ16612 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NREPQ16612 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NREPQ16612 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NREPQ16612 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NREPQ16612 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NREPQ16612 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NREPQ16612 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NREPQ16612 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NREPQ16612 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NREPQ16612 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NREPQ16612 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NREPQ16612 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NREPQ16612 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NREPQ16612 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NREPQ16612 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NREPQ16612 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NREPQ16612 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NREPQ16612 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NREPQ16612 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NREPQ16612 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NREPQ16612 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NREPQ16612 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NREPQ16612 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NREPQ16612 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NREPQ16612 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NREPQ16612 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NREPQ16612 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NREPQ16612 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NREPQ16612 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NREPQ16612 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NREPQ16612 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NREPQ16612 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NREPQ16612 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NREPQ16612 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NREPQ16612 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NREPQ16612 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NREPQ16612 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NREPQ16612 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NREPQ16612 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NREPQ16612 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NREPQ16612 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NREPQ16612 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NREPQ16612 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NREPQ16612 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NREPQ16612 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NREPQ16612 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NREPQ16612 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NREPQ16612 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NREPQ16612 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NREPQ16612 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NREPQ16612 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NREPQ16612 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NREPQ16612 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NREPQ16612 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NREPQ16612 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NREPQ16612 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NREPQ16612 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NREPQ16612 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NREPQ16612 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NREPQ16612 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NREPQ16612 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NREPQ16612 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NREPQ16612 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NREPQ16612 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NREPQ16612 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NREPQ16612 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NREPQ16612 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NREPQ16612 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NREPQ16612 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NREPQ16612 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NREPQ16612 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NREPQ16612 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NREPQ16612 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NREPQ16612 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NREPQ16612 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NREPQ16612 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms