Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP35Q16560 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms