Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKN1Q16512 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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