Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
E2F4Q16254 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F4Q16254 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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