Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USF2Q15853 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USF2Q15853 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USF2Q15853 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USF2Q15853 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USF2Q15853 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USF2Q15853 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USF2Q15853 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USF2Q15853 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USF2Q15853 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USF2Q15853 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USF2Q15853 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USF2Q15853 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USF2Q15853 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USF2Q15853 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USF2Q15853 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USF2Q15853 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USF2Q15853 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USF2Q15853 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USF2Q15853 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USF2Q15853 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USF2Q15853 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USF2Q15853 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USF2Q15853 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USF2Q15853 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USF2Q15853 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USF2Q15853 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USF2Q15853 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USF2Q15853 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USF2Q15853 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USF2Q15853 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USF2Q15853 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USF2Q15853 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USF2Q15853 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USF2Q15853 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USF2Q15853 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USF2Q15853 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USF2Q15853 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USF2Q15853 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USF2Q15853 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USF2Q15853 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USF2Q15853 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USF2Q15853 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USF2Q15853 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USF2Q15853 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USF2Q15853 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USF2Q15853 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USF2Q15853 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USF2Q15853 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USF2Q15853 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USF2Q15853 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USF2Q15853 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USF2Q15853 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USF2Q15853 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USF2Q15853 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USF2Q15853 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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