Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC85BQ15834 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC85BQ15834 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85BQ15834 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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