Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHRNA2Q15822 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHRNA2Q15822 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHRNA2Q15822 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CHRNA2Q15822 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHRNA2Q15822 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHRNA2Q15822 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHRNA2Q15822 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CHRNA2Q15822 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHRNA2Q15822 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CHRNA2Q15822 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CHRNA2Q15822 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CHRNA2Q15822 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CHRNA2Q15822 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHRNA2Q15822 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHRNA2Q15822 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
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