Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NPTX1Q15818 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPTX1Q15818 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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