Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR6A1Q15406 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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