Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IRF4Q15306 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF4Q15306 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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