Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABEP1Q15276 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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