Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRRQ15256 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRRQ15256 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms