Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NECTIN1Q15223 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NECTIN1Q15223 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
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