Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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