Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLD3Q15054 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD3Q15054 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms