Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAM2Q15035 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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