Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC1AQ14683 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
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