Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDC1Q14676 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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