Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FAT1Q14517 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAT1Q14517 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAT1Q14517 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAT1Q14517 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAT1Q14517 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAT1Q14517 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FAT1Q14517 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAT1Q14517 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAT1Q14517 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAT1Q14517 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FAT1Q14517 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms