Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53BQ14153 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM53BQ14153 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms