Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPSQ13938 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPSQ13938 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPSQ13938 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms