Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR4Q13639 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
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