Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DNASE1L3Q13609 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNASE1L3Q13609 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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