Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C1orf61Q13536 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms