Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSAMPQ13449 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSAMPQ13449 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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